MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Enterococcus faecium Aus0085 plasmid p3

Total Repeats: 161

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021988	AT	3	6	1455	1460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021988	GGT	2	6	1507	1512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021988	TTTA	2	8	1862	1869	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021988	ACTC	2	8	2844	2851	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_021988	T	6	6	2898	2903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021988	A	6	6	2938	2943	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021988	GCT	2	6	2966	2971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_021988	GAA	2	6	3010	3015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021988	ATTG	2	8	4123	4130	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021988	A	7	7	4224	4230	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021988	AAAT	2	8	4266	4273	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021988	AGG	2	6	4329	4334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021988	GTA	2	6	4335	4340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021988	GGA	2	6	4386	4391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021988	TTTA	2	8	5248	5255	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021988	TAA	2	6	5281	5286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021988	AGTA	2	8	5287	5294	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021988	A	6	6	5336	5341	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021988	T	6	6	5366	5371	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021988	ATT	2	6	5387	5392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021988	AGAAT	2	10	5410	5419	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021988	TTG	2	6	5464	5469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021988	AAG	2	6	5486	5491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021988	AGAA	2	8	5496	5503	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021988	A	6	6	6883	6888	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021988	AGT	2	6	6896	6901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021988	A	6	6	6906	6911	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021988	ACT	2	6	6917	6922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_021988	T	7	7	6924	6930	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021988	T	7	7	7013	7019	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021988	AATT	2	8	7039	7046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021988	TTTG	2	8	7930	7937	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021988	TATT	2	8	7999	8006	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021988	CTT	2	6	8098	8103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_021988	TAT	2	6	8142	8147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021988	AC	3	6	8175	8180	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_021988	CAC	2	6	8349	8354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_021988	T	6	6	8355	8360	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021988	TAA	2	6	8390	8395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021988	AG	3	6	8404	8409	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021988	TAT	2	6	9423	9428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021988	TTCC	2	8	9429	9436	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_021988	AAG	2	6	9465	9470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021988	GTT	2	6	9550	9555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021988	AT	3	6	9696	9701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021988	GC	3	6	9708	9713	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_021988	TCT	2	6	9755	9760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_021988	GTG	2	6	9777	9782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021988	T	6	6	9791	9796	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021988	CAA	2	6	9830	9835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_021988	A	7	7	9834	9840	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021988	TAG	2	6	9847	9852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021988	CTC	2	6	11956	11961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_021988	T	6	6	11967	11972	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021988	TCC	2	6	13573	13578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_021988	ATT	2	6	13875	13880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021988	AAT	2	6	14631	14636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021988	ATA	2	6	14658	14663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021988	GA	3	6	14675	14680	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021988	AC	3	6	14721	14726	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_021988	CAA	2	6	14763	14768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_021988	ATTG	2	8	14781	14788	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021988	AAC	2	6	14812	14817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_021988	ATCTA	2	10	14823	14832	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_021988	CTA	2	6	14905	14910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_021988	GAA	2	6	14995	15000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021988	CA	3	6	15096	15101	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_021988	CAC	2	6	15136	15141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_021988	A	6	6	15159	15164	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021988	ATG	2	6	15198	15203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021988	AAC	2	6	15222	15227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_021988	AAT	2	6	15242	15247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021988	GAAT	2	8	15296	15303	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021988	T	6	6	15391	15396	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021988	TTC	2	6	16258	16263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_021988	TTC	2	6	17800	17805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_021988	ATTA	2	8	17851	17858	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021988	ATGA	2	8	17895	17902	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021988	CTTT	2	8	17934	17941	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_021988	TAT	2	6	17996	18001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021988	ACATA	2	10	18015	18024	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_021988	TAT	2	6	18039	18044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021988	AACAA	2	10	18081	18090	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_021988	TTA	2	6	18120	18125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021988	CAT	2	6	18128	18133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_021988	TTC	2	6	18158	18163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_021988	TAT	2	6	18180	18185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021988	TTC	2	6	18215	18220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_021988	TAAA	2	8	18676	18683	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021988	AGT	2	6	19219	19224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021988	TCG	2	6	19253	19258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_021988	TAG	2	6	19330	19335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021988	AAT	2	6	19347	19352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021988	CTG	2	6	19359	19364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_021988	TCC	2	6	19398	19403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_021988	TAT	2	6	19417	19422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021988	TAG	2	6	19437	19442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021988	TA	3	6	19476	19481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021988	AAT	2	6	19511	19516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021988	ACT	2	6	19529	19534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_021988	CAC	2	6	19535	19540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_021988	CTT	2	6	19580	19585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_021988	TGA	2	6	19673	19678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021988	TCA	2	6	21372	21377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_021988	A	6	6	21418	21423	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021988	T	6	6	21434	21439	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021988	TTTA	2	8	21744	21751	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021988	TATAT	2	10	21808	21817	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021988	TA	3	6	21828	21833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021988	TAAA	2	8	21841	21848	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021988	GGA	2	6	21853	21858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021988	AGG	2	6	22975	22980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021988	TGT	2	6	23031	23036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021988	ATG	2	6	23163	23168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021988	AGAA	2	8	23809	23816	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021988	CTA	2	6	23841	23846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_021988	AAT	2	6	23860	23865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021988	AGG	2	6	23879	23884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021988	TTTA	2	8	24601	24608	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021988	TGT	2	6	26029	26034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021988	ATA	2	6	26040	26045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021988	T	7	7	26046	26052	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021988	A	6	6	26072	26077	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021988	TTA	2	6	26238	26243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021988	ATAA	2	8	26247	26254	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021988	CTG	2	6	26352	26357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_021988	TAATA	2	10	26359	26368	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021988	TAG	2	6	26424	26429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021988	TAA	2	6	26831	26836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021988	GT	3	6	26845	26850	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021988	ACCA	2	8	26876	26883	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_021988	TAG	2	6	26891	26896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021988	ATG	2	6	26977	26982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021988	T	7	7	26995	27001	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021988	CTT	2	6	27025	27030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_021988	CCT	2	6	27065	27070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_021988	ATA	2	6	28585	28590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021988	TAA	2	6	28609	28614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021988	ACA	2	6	28620	28625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_021988	TGT	2	6	29013	29018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021988	AGGATT	2	12	29047	29058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021988	AGTA	2	8	29076	29083	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021988	AT	3	6	29090	29095	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021988	TACT	2	8	29111	29118	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_021988	AT	3	6	30350	30355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021988	AT	3	6	30377	30382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021988	AT	3	6	30386	30391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021988	AT	3	6	30452	30457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021988	AT	3	6	30479	30484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_021988	AT	3	6	30498	30503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_021988	A	8	8	30628	30635	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_021988	AAT	2	6	30644	30649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_021988	ATT	2	6	30667	30672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_021988	ACT	2	6	30735	30740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_021988	A	7	7	30789	30795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_021988	AGA	2	6	30811	30816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
157	NC_021988	TTTA	2	8	30820	30827	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_021988	TTAAA	2	10	30834	30843	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_021988	AG	3	6	30860	30865	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
160	NC_021988	TTTG	2	8	30909	30916	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
161	NC_021988	TACA	2	8	30980	30987	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.